Onde Utilizar?
- Aplicação Web: clicando aqui
- Pacote de Python: clicando aqui
Sobre a Ferramenta
A ferramenta BioSTAR (Bioinformatics Software for Targeted Analysis and Research) foi desenvolvida por Nicolas Martins, fundador do BioApps, como tema central da monografia durante sua graduação em Bioquímica. Mesmo depois da graduação, o projeto continuou a ser desenvolvido ativamente e novas funcionalidades são implementadas frequentemente.
O pacote pode ser utilizado de forma modular e sem dependências externas de nenhuma outra biblioteca e é compatível com qualquer versão do Python 3.7 ou superior. O repositório do GitHub está documentado, além do site também apresentar uma documentação.
A ferramenta web é um compilado de funções modulares que trás as funcionalidades:
Análise Genômica:
- Trabalha e converte sequências DNA <=> RNA;
- Geração da sequência genética complementar de qualquer sequência isolada de DNA;
- Identificação de ORFs e mapeamento de proteínas hipotéticas em um genômica;
- Comparação entre duas sequências genéticas para identificar e classificar mutações;
- Traduz sequências de RNA, ou diretamente de DNA em proteínas
Análise Proteômica:
- Aromaticidade;
- Coeficiente de extinção;
- Carga teórica em diferentes faixas de pH;
- Massa molecular;
- Ponto Isoelétrico teórico.
- Propensão de estruturas secundárias (α-Hélice, Folha-β, espiral)
Outras funcionalidades:
- Padronização de sequências para o formato FASTA;
- Exportar resultados para .csv, .json, .xls (Excel);
- Dicionário de aminoácidos com lista de propriedades físico-quimicas.